O recente surto na Alemanha de uma infecção por Escherichia coli resultou em sérias preocupações sobre o possível aparecimento de uma nova cepa letal de bactérias.

Em resposta a esta situação, e imediatamente após os relatos das mortes, o Centro Médico da Universidade de Hamburgo-Eppendorf e BGI-Shenzhen começaram a trabalhar juntos para sequenciar a bactéria e avaliar o seu risco para a saúde humana.

BGI-Shenzhen acaba de completar o sequenciamento e análise preliminar mostra que a infecção é causada por uma cepa completamente nova de E. Coli super-tóxica.

Segundo o mais recente anúncio das autoridades de saúde alemã, o número de mortos na Europa a partir da epidemia aumentou para pelo menos 17. Mais de 1.000 novos casos de infecção também foram relatados em outras partes da Europa, incluindo Suécia, Dinamarca, Países Baixos, Reino Unido e outros.

O Centro Médico da Universidade de Hamburgo-Eppendorf recebeu a maioria dos pacientes infectados do norte da Alemanha e constatou que o tratamento antibiótico é ineficaz. O BGI, em colaboração com pesquisadores Centro Médico da Universidade de Hamburg-Eppendorf, usou a tecnologia genômica para determinar a cepa infecciosa, revelar os mecanismos de infecção e facilitar o desenvolvimento de medidas para controlar a propagação desta epidemia.

Usando uma plataforma de sequenciamento de terceira geração - Ion Torrent por Life Technologies, o BGI realizou o seqüenciamento do genoma da bactéria no prazo de três dias.

A análise bioinformática revelou que este E. coli é uma nova cepa de bactéria altamente infecciosa e tóxica. A análise da sequência indica que esta bactéria é uma cepa de E.coli EHEC*1 sorotipo O104, no entanto, este é um novo sorotipo - não envolvido em surtos anteriores de E. coli.

A análise comparativa mostrou que esta bactéria tem 93% de similaridade de seqüência com a cepa de E. coli EAEC 55989, que foi isolada na República da África Central e conhecida por causar diarreia grave. Esta nova cepa de E. coli, entretanto, também adquiriu sequências específicas que parecem ser semelhantes àquelas envolvidas na patogênese da colite hemorrágica e síndrome hemolítico-urêmica. A aquisição desses genes pode ter ocorrido por meio da transferência horizontal de genes.

A análise revelou ainda que esta bactéria mortal carrega diversos genes de resistência a antibióticos, incluindo a resistência a aminoglicosídeos, macrolídeos e antibióticos beta-lactâmicos, o que torna extremamente difícil o tratamento com antibióticos.

A equipe de pesquisadores vai continuar analisando a integridade da virulência dos genes, seus perfis de expressão, a resistência às drogas, e os mecanismos de transferência de genes seguida pela validação desses genes em outras espécies. Além disso o BGI e colaboradores estão desenvolvendo kits de diagnóstico para auxiliar na redução dessa epidemia. Novos resultados serão atualizadas continuamente.

*1EHEC - E. coli entero-hemorrágica (enterohaemorrhagic E. coli)

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